RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 NSD2O96028 1365 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TLDC2A0PJX2 215 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 FAM177BA6PVY3 158 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CTAGE5O15320 804 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TUBB2AQ13885 445 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 BRD3Q15059 726 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 ELF2Q15723 593 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 MORN1Q5T089 497 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TTC22Q5TAA0 569 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CCDC102BQ68D86 513 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 GPR153Q6NV75 609 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TMX3Q96JJ7 454 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 PXDNQ92626 1479 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 PHLPP1O60346 1717 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 SFI1A8K8P3 1242 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 RIMBP2O15034 1052 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 ERC2O15083 957 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 SMC2O95347 1197 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 PTGS1P23219 599 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 GTF2IP78347 998 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 ICA1Q05084 483 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TMC7Q7Z402 723 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 SMARCE1Q969G3 411 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.28□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 14.8
PKP4-211ENST00000481115 ALS2Q96Q42 1657 aa8.27□□□□□ -1.08
PKP4-211ENST00000481115 CCDC151A5D8V7 595 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 PPFIA4O75335 1185 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKP4-211ENST00000481115 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 MTMR3Q13615 1198 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 PKP1Q13835 747 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 CRYMQ14894 314 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 MAP3K11Q16584 847 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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PKP4-211ENST00000481115 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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PKP4-211ENST00000481115 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKP4-211ENST00000481115 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 CABP1Q9NZU7 370 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKP4-211ENST00000481115 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 DNAI1Q9UI46 699 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKP4-211ENST00000481115 ACEP12821 1306 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ERBB3P21860 1342 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.27□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PP64 1363 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 H0YHG0 523 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 MAP2K7O14733 419 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 TREHO43280 583 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 FAM13AO94988 1023 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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