RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		28.09	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	SLF2	Q8IX21	1173 aa		28.09	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	CEP85	Q6P2H3	762 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	ABHD8	Q96I13	439 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	GAK	O14976	1311 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	INHBE	P58166	350 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	SPATA5	Q8NB90	893 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	28.07	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	FAM151A	Q8WW52	585 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	MAP3K9	P80192	1104 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	ELP3	Q9H9T3	547 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	CSAD	Q9Y600	493 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	ALDH1A1	P00352	501 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	VGLL4	Q14135	290 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	DCAF15	Q66K64	600 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	GJA5	P36382	358 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	DGKZ	Q13574	1117 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	PI16	Q6UXB8	463 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	OPTN	Q96CV9	577 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	TBC1D8	O95759	1140 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	MCAM	P43121	646 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	TCP10	Q12799	353 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	NFIA	Q12857	509 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	MECOM	Q03112	1051 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	IFNL1	Q8IU54	200 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	WRNIP1	Q96S55	665 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MKL1-208	ENST00000466278	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	DOCK2	Q92608	1830 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	BTD	P43251	543 aa		28	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	GSTO1	P78417	241 aa		28	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		28	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		28	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ENTPD3	O75355	529 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	RAI14	Q9P0K7	980 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	GPR25	O00155	361 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	LDHC	P07864	332 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	RGS3	P49796	1198 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MKL1-208	ENST00000466278	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	GTF2A2	P52657	109 aa		27.95	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	ERO1B	Q86YB8	467 aa		27.95	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		27.95	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	HMMR	O75330	724 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	FKTN	O75072	461 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.93	■■■□□ 2.06

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