RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 USP40Q9NVE5 1235 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 TNNI2P48788 182 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 BAG3O95817 575 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PDE6AP16499 860 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 APLP1P51693 650 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 CACNB3P54284 484 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 DLK2Q6UY11 383 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 CDCA5Q96FF9 252 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 HSPA6P17066 643 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 RASA3Q14644 834 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PLCG2P16885 1265 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PDE4AP27815 886 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PPP4CP60510 307 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 ADD2P35612 726 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 RHBDL3P58872 404 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 FAM83AQ86UY5 434 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 CERS3Q8IU89 383 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 NF2P35240 595 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 TEX11Q8IYF3 940 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 IDI2Q9BXS1 227 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 DOCK2Q92608 1830 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 NFIAQ12857 509 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 UBE3CQ15386 1083 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 CST9Q5W186 159 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 FAM151AQ8WW52 585 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 EVI5LQ96CN4 794 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 FSD1Q9BTV5 496 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-202ENST00000440447 CNTNAP1P78357 1384 aa22.08■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 RGS3P49796 1198 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 TCP10Q12799 353 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 CREBZFQ9NS37 354 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 ENTPD3O75355 529 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 PICALMQ13492 652 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.05■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 TEPSINQ96N21 525 aa22.05■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 CHGBP05060 677 aa22.04■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 RILPL2Q969X0 211 aa22.04■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 FKBP1BP68106 108 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 APPBP2Q92624 585 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 HOOK2Q96ED9 719 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 USP5P45974 858 aa22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 AIDAQ96BJ3 306 aa22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTX4-202ENST00000440447 MBD4O95243 580 aa22.01■■□□□ 1.11
PTX4-202ENST00000440447 HTRA3P83110 453 aa22.01■■□□□ 1.11
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