RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427786.1

PPP1CB-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-206ENST00000427786 TNNI3KQ59H18 835 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 PI16Q6UXB8 463 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF384Q8TF68 577 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 NFIAQ12857 509 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 CAPN15O75808 1086 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 MCAMP43121 646 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PPP1CB-206ENST00000427786 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 MS4A1P11836 297 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 SPATA5Q8NB90 893 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM151AQ8WW52 585 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ABHD8Q96I13 439 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCF2Q9UG63 623 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 VGLL4Q14135 290 aa24.13■■□□□ 1.45
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PPP1CB-206ENST00000427786 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.13■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.12■■□□□ 1.45
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PPP1CB-206ENST00000427786 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ELP3Q9H9T3 547 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 INHBEP58166 350 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 MAP3K9P80192 1104 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 MECOMQ03112 1051 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 GORABQ5T7V8 394 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 OPTNQ96CV9 577 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 IDI2Q9BXS1 227 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 USP40Q9NVE5 1235 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 TBC1D8O95759 1140 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 IFNL1Q8IU54 200 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 HOOK2Q96ED9 719 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.1■■□□□ 1.45
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PPP1CB-206ENST00000427786 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 COG6Q9Y2V7 657 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 TCP10Q12799 353 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 AK9Q5TCS8 1911 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 BTDP43251 543 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 RHBDL3P58872 404 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 DCAF15Q66K64 600 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 SLF2Q8IX21 1173 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 WRNIP1Q96S55 665 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP1CB-206ENST00000427786 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.07■■□□□ 1.44
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PPP1CB-206ENST00000427786 ALDH1A1P00352 501 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 RGS3P49796 1198 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 DGKZQ13574 1117 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 PTPN18Q99952 460 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 CSADQ9Y600 493 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 FOCADQ5VW36 1801 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 HTTP42858 3142 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 GPR25O00155 361 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 INPP5BP32019 993 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 PDE3AQ14432 1141 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-206ENST00000427786 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.04■■□□□ 1.44
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