RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 SLC1A4P43007 532 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 KRT83P78385 493 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 UBXN1Q04323 297 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 UBE4AQ14139 1066 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 NIM1KQ8IY84 436 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 ERICH4A6NGS2 130 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 ELP1O95163 1332 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 DDX12PQ92771 950 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 KIF5AQ12840 1032 aa22.83■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 DPH6Q7L8W6 267 aa22.83■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 IL17REQ8NFR9 667 aa22.83■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 LRRC45Q96CN5 670 aa22.83■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP25-202ENST00000285681 CTR9Q6PD62 1173 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 KIF4AO95239 1232 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CTSWP56202 376 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CCDC175P0C221 793 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 PPP2R5BQ15173 497 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 A0A1B0GVL5 298 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 DLGAP5Q15398 846 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 DNAI1Q9UI46 699 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 KRT86O43790 486 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CTAGE8P0CG41 777 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 TCP10Q12799 353 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 PPIP5K2O43314 1243 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 PPP1R2P41236 205 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CEP83Q9Y592 693 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 PLXNC1O60486 1568 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CHMP2AO43633 222 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 TMEM94Q12767 1356 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 KCNQ3O43525 872 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 SEC24BO95487 1268 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 STAMBPO95630 424 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ATP5JP18859 108 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ANO1Q5XXA6 986 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 INSRP06213 1382 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 TRAF5O00463 557 aa22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 GJC1P36383 396 aa22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 SMTNP53814 917 aa22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.79■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ZBED4O75132 1171 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 GTF2IP78347 998 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ERBB4Q15303 1308 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 TTC16Q8NEE8 873 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 TXKP42681 527 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 ADCY7P51828 1080 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 PRKG1Q13976 671 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 IFNKQ9P0W0 207 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CPXCR1Q8N123 301 aa22.77■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.77■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 CEP112Q8N8E3 955 aa22.77■■□□□ 1.24
USP25-202ENST00000285681 MYL5Q02045 173 aa22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms