RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 TAS2R30P59541 319 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 ZNF846Q147U1 533 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 ACTL10Q5JWF8 245 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 SOCS3O14543 225 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 C4BPBP20851 252 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 DLK1P80370 383 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 C1orf194Q5T5A4 169 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 IL17DQ8TAD2 202 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 C17orf77Q96MU5 243 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 K7EPK0 472 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 DEFB1P60022 68 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 C5orf51A6NDU8 294 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 IL5P05113 134 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 ORM2P19652 201 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 IL15RAQ13261 267 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 HYDINQ4G0P3 5121 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 OR10P1Q8NGE3 313 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 OR11H2Q8NH07 326 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 C2orf50Q96LR7 162 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 RARRES2Q99969 163 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 DOK5Q9P104 306 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 FBXL17Q9UF56 701 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 LCE6AA0A183 80 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 ZNF98A6NK75 572 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 FNDC10F2Z333 226 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 ENKURQ8TC29 256 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-222ENST00000550996 H3BMM0 161 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SPP1P10451 314 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 GDF5OSQ5U4N7 250 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SLC25A22Q9H936 323 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 H3BRN7 92 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 DEDDO75618 318 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 LINC00869P0C866 280 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 PMS2P11Q13670 270 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 BATF3Q9NR55 127 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 L7N2F9 121 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 PSMB3P49720 205 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 PLP1P60201 277 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 VAMP2P63027 116 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 RAB32Q13637 225 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 C20orf173Q96LM9 149 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 LINC00052Q96N35 136 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 CLEC5AQ9NY25 188 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 DEFB4AO15263 64 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 CST7O76096 145 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 HLA-DRB4P13762 266 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 S100A10P60903 97 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 TEPPQ6URK8 271 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 PATE2Q6UY27 113 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 UHRF2Q96PU4 802 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 RSG1Q9BU20 258 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 GGACTQ9BVM4 153 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 HYPMO75409 117 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SIX6O95475 246 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 GALR1P47211 349 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 BCAP31P51572 246 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 CAV2P51636 162 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SELENOTP62341 195 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 Q8NAQ8 132 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 MGST2Q99735 147 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 HIGD1AQ9Y241 93 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 IGSF23A1L1A6 192 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 CXorf65A6NEN9 183 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 F6UB75 175 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 ISLRO14498 428 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 ID1P41134 155 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CS-222ENST00000550996 X6R8D5 127 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms