RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 DSCR9P59020 149 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 KLK9Q2XQG4 91 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PPP5D1E7EU14 171 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 F8W735 103 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BKO60814 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV2-8P01709 118 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BJP06899 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BOP23527 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BBP33778 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BDP58876 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TAS2R60P59551 318 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BCP62807 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 BTF3L4Q96K17 158 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PEX7O00628 323 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 GNG7O60262 68 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 AKR1D1P51857 326 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 RANP62826 216 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 Q5PR19 223 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FRZBQ92765 325 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 RNF125Q96EQ8 232 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FOXC2Q99958 501 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 H3BRN7 92 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V0E1O15342 81 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 GCGP01275 180 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 MSMBP08118 114 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TRGC1P0CF51 173 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 OR5I1Q13606 314 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 LEMD1Q68G75 181 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 BLNKQ8WV28 456 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM68Q96MH6 324 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 S4R3C0 116 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIVEP1P15822 2718 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 OR2J3O76001 311 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFB8O95169 186 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IL4P05112 153 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ERVFC1-1P60608 527 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PIFOQ8TCI5 191 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TXN2Q99757 166 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 OSTCQ9NRP0 149 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IL36BQ9NZH7 164 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PGPA6NDG6 321 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ISLRO14498 428 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A16P16260 332 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HOXA5P20719 270 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 Q56UQ5 140 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00479Q96M42 142 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 EPDR1Q9UM22 224 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 V9GYV3 84 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 AKAP9Q99996 3911 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0U1RQK1 487 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 B4DSR2 109 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SLC17A3O00476 420 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SCGB2A1O75556 95 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA6P56556 154 aa6.41□□□□□ -1.38
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