RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RNF2Q99496 336 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ARL6Q9H0F7 186 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 CORTO00230 105 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 S100A11P31949 105 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 BMI1P35226 326 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 OPRK1P41145 380 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 TFPI2P48307 235 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 HBG1P69891 147 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 HBG2P69892 147 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZWC4 215 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 RNF183Q96D59 192 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ATP5SQ99766 215 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 SMPXQ9UHP9 88 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 K7EMT4 169 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 CHEK1O14757 476 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 BCL2L11O43521 198 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 VWC2Q2TAL6 325 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 LILRB2Q8N423 598 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 STPG3Q8N7X2 389 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 GGACTQ9BVM4 153 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 NUPR2A6NF83 97 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 OR4C46A6NHA9 309 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 FNDC10F2Z333 226 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 UBE2CO00762 179 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 YIF1AO95070 293 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 GAMTQ14353 236 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 OPCMLQ14982 345 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V1FQ16864 119 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 SLC35E1Q96K37 410 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 SMCO3A2RU48 225 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 TAAR5O14804 337 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 DFFBO76075 338 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 RND2P52198 227 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 MFAP4P55083 255 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 NPIPB3Q92617 1050 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ACY3Q96HD9 319 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V0BQ99437 205 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 AKR1C1Q04828 323 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 OR4X1Q8NH49 305 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 IFNA5P01569 189 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 ZNF266Q14584 549 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 THAP8Q8NA92 274 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 ST8SIA2Q92186 375 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 ARV1Q9H2C2 271 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 KMT2AQ03164 3969 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 GNG7O60262 68 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 CLN5O75503 358 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 C4BPBP20851 252 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 FGF7P21781 194 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 TCF24Q7RTU0 167 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 SLC51BQ86UW2 128 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 STOML3Q8TAV4 291 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-212ENST00000485532 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms