RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484658.1

RAB3GAP2-208, Transcript of RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2, human

TSL 4

Gene RAB3GAP2, Length 515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DOK5	Q9P104	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ISLR	O14498	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FCGR2C	P31995	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LPAR6	P43657	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q6ZRU5	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A0A0MQY5	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A0B4J293	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		M0R2Z0	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GYG2	O15488	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ELK1	P19419	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DHODH	Q02127	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC01587	Q99440	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		V9GY05	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MYL12B	O14950	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PSCA	O43653	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IL4	P05112	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	EVI2A	P22794	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SNCA	P37840	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HSPA13	P48723	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FHL2	Q14192	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SSX5	O60225	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TOMM40	O96008	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UCP1	P25874	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PSMB9	P28065	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OPRK1	P41145	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HES5	Q5TA89	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GAGE7	O76087	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RLN2	P04090	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RLN1	P04808	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PTHLH	P12272	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FXYD4	P59646	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms