RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.74□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 FNDC10F2Z333 226 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 BCAP31P51572 246 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 DEFA1P59665 94 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 DEFA3P59666 94 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 RAB32Q13637 225 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 STHQ8IWL8 128 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 RNF183Q96D59 192 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 GGACTQ9BVM4 153 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 NRN1Q9NPD7 142 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 FBXL17Q9UF56 701 aa6.73□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 ZNF98A6NK75 572 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 KNCNA6PVL3 124 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 PRAF2O60831 178 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 DEDDO75618 318 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 SIX6O95475 246 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 CAV2P51636 162 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 S100A10P60903 97 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 SELENOTP62341 195 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 PSMG4Q5JS54 123 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 TEPPQ6URK8 271 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.72□□□□□ -1.33
SYN3-211ENST00000472027 GOSR2O14653 212 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CST7O76096 145 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 LINC00869P0C866 280 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 S100A7P31151 101 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PLP1P60201 277 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A22Q9H936 323 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 DOK5Q9P104 306 aa6.71□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 A0A0J9YWU9 116 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 IGSF23A1L1A6 192 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SOCS3O14543 225 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 AGPAT2O15120 278 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 HYPMO75409 117 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 OR5G3P0C626 314 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ID1P41134 155 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 GALR1P47211 349 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RAP2BP61225 183 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PATE2Q6UY27 113 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 IL17DQ8TAD2 202 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 LINC00052Q96N35 136 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RARRES2Q99969 163 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RSG1Q9BU20 258 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 NMES1Q9C002 83 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ARL6Q9H0F7 186 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.7□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 H3BMM0 161 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 H3BRN7 92 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RLN2P04090 185 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SPP1P10451 314 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 S100A11P31949 105 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PSMB3P49720 205 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SULT1A1P50225 295 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ZNF546Q86UE3 836 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 OR11H2Q8NH07 326 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 C16orf92Q96LL3 132 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 C17orf77Q96MU5 243 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 GPR82Q96P67 336 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 UHRF2Q96PU4 802 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 MGST2Q99735 147 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ARV1Q9H2C2 271 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.69□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 E5RGE8 158 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 H0YIZ8 118 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ISLRO14498 428 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SSNA1O43805 119 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 C4BPBP20851 252 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CAMLGP49069 296 aa6.68□□□□□ -1.34
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