RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-208ENST00000469602 GGACTQ9BVM4 153 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 NRN1Q9NPD7 142 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 FBXL17Q9UF56 701 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 UBE2CO00762 179 aa7.18□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 DEDDO75618 318 aa7.18□□□□□ -1.26
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SRRT-208ENST00000469602 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 BCAP31P51572 246 aa7.18□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SELENOTP62341 195 aa7.18□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 TEPPQ6URK8 271 aa7.18□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.18□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 Q6ZWC4 215 aa7.18□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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SRRT-208ENST00000469602 SSNA1O43805 119 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 CST7O76096 145 aa7.17□□□□□ -1.26
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SRRT-208ENST00000469602 S100A7P31151 101 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 DEFB135Q30KP9 77 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 STX12Q86Y82 276 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 MUC7Q8TAX7 377 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 NMES1Q9C002 83 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 IGSF23A1L1A6 192 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 ZNF98A6NK75 572 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 C3orf84H3BNL1 204 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 HYPMO75409 117 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 PTTG1O95997 202 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 LINC00869P0C866 280 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SULT1A1P50225 295 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 H2BFSP57053 126 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 PLP1P60201 277 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 HBG1P69891 147 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 HBG2P69892 147 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 PSMG4Q5JS54 123 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 ZNF546Q86UE3 836 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 STHQ8IWL8 128 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 CSTL1Q9H114 145 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SLC25A22Q9H936 323 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 DOK5Q9P104 306 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 AGPAT2O15120 278 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SPRY2O43597 315 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 RLN2P04090 185 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 S100A11P31949 105 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 GALR1P47211 349 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 RAP2BP61225 183 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 RAB31Q13636 194 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 VWC2Q2TAL6 325 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 RNF183Q96D59 192 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 GPR82Q96P67 336 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 MGST2Q99735 147 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-208ENST00000469602 KNCNA6PVL3 124 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 E5RGE8 158 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 H3BRN7 92 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 SOCS3O14543 225 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 OR5G3P0C626 314 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 LYL1P12980 280 aa7.14□□□□□ -1.27
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SRRT-208ENST00000469602 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 S100A7AQ86SG5 101 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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SRRT-208ENST00000469602 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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SRRT-208ENST00000469602 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 H0YIZ8 118 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ISLRO14498 428 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 SPP1P10451 314 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ID1P41134 155 aa7.13□□□□□ -1.27
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