RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 KRASP01116 189 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 IFNA7P01567 189 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 PET100P0DJ07 73 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 F2RP25116 425 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 H2BFSP57053 126 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 PIGPP57054 158 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB131AP59861 70 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SRPXP78539 464 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM187Q14656 261 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZTC4 211 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TCF24Q7RTU0 167 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 CMTM1Q8IZ96 169 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.73□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 FXYD6Q9H0Q3 95 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 VSIRQ9H7M9 311 aa4.73□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0D9SG52 128 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00862A6NCI5 91 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 C15orf61A6NNL5 157 aa4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 DFFBO76075 338 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 MT-CO2P00403 227 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1-39P01597 117 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 RLN2P04090 185 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1D-39P04432 117 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DMBP28068 263 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TCTAP57738 103 aa4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 OPCMLQ14982 345 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 OR1P1Q8NH06 330 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SEC22AQ96IW7 307 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 NMES1Q9C002 83 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 PKD1P98161 4303 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GU03 582 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 KNCNA6PVL3 124 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 GPR31O00270 319 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 ARPC5O15511 151 aa4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 MPC2O95563 127 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A4P12235 298 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 CXCL2P19875 107 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 S100A11P31949 105 aa4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM230Q96A57 120 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 C2orf50Q96LR7 162 aa4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 NAA60Q9H7X0 242 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 CELA1Q9UNI1 258 aa4.72□□□□□ -1.65
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HOXD8-202ENST00000429017 C11orf94C9JXX5 98 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 K7EQG2 157 aa4.71□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 ST8SIA3O43173 380 aa4.71□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 RND3P61587 244 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 CLLU1Q5K131 121 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 TMUB2Q71RG4 321 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF114Q8NC26 417 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.71□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM56Q96MV1 263 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 TXN2Q99757 166 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 ARL6Q9H0F7 186 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
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