RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIGPP57054 158 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 WFDC2Q14508 124 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ODF1Q14990 250 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 AARDQ4LEZ3 155 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 C2orf83Q53S99 150 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZTI0 123 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPX8Q8TED1 209 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABHD1Q96SE0 405 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 C8orf4Q9NR00 106 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACNG5Q9UF02 275 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIVA1O15304 175 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR5AC1P0C628 307 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC25A4P12235 298 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 UCP1P25874 307 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 CBX5P45973 191 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAS2R46P59540 309 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 RND3P61587 244 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC01620Q4KN68 170 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 NMSQ5H8A3 153 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPARTQ8N0X7 666 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 BORCS5Q969J3 196 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 C16orf92Q96LL3 132 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNBD2Q96M20 576 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC01587Q99440 93 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 RSG1Q9BU20 258 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC25A22Q9H936 323 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPRMQ9NS64 109 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0A6YYH2 397 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 A6NJ64 397 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAC2D3DTV9 90 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFNA5P01569 189 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 PGAM2P15259 253 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ID1P41134 155 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 RANBP1P43487 201 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 UCP3P55916 312 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPCS3P61009 180 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPAN5P62079 268 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAMTQ14353 236 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM16LQ309B1 348 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZQT7 251 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM219AQ8IW50 185 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF738Q8NE65 137 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 C16orf74Q96GX8 76 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENY2Q9NPA8 101 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 DIABLOQ9NR28 239 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF98A6NK75 572 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFP92A6NM28 416 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 H3BTX0 84 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 J3KRW8 73 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCNKO75909 580 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-53P01767 116 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 MT1HL1P0DM35 61 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRSS3P35030 304 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 RCVRNP35243 200 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCAND1P57086 179 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAS2R60P59551 318 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 FGL1Q08830 312 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZSA8 131 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms