RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562261.1

KLHDC4-208, Transcript of kelch domain containing 4, human

TSL 3

Gene KLHDC4, Length 1,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLHDC4-208	ENST00000562261	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KLHDC4-208	ENST00000562261	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KLHDC4-208	ENST00000562261	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KLHDC4-208	ENST00000562261	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KLHDC4-208	ENST00000562261	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KLHDC4-208	ENST00000562261	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KLHDC4-208	ENST00000562261	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KLHDC4-208	ENST00000562261	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	SSNA1	O43805	119 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	CRYBB3	P26998	211 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	LEMD1	Q68G75	181 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	RARRES2	Q99969	163 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	SLC25A4	P12235	298 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	CXCL3	P19876	107 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	P2RY1	P47900	373 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	SRPX	P78539	464 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	NOXA1	Q86UR1	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	RYR1	P21817	5038 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261		K7EQG2	157 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	NXPH3	O95157	252 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	LY6G6C	O95867	125 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	RND2	P52198	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	CD300C	Q08708	224 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	TMEM187	Q14656	261 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	OR11H2	Q8NH07	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	NPY1R	P25929	384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	OR10J1	P30954	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	FGL1	Q08830	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	STH	Q8IWL8	128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261		Q8WTZ3	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	NMES1	Q9C002	83 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	AKR1C4	P17516	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	H2BFS	P57053	126 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261		U3KQE9	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261		G3V3Q6	166 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	IL15RA	Q13261	267 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	SMCO1	Q147U7	214 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	AGRN	O00468	2067 aa		11.08	□□□□□ -0.63
KLHDC4-208	ENST00000562261	HELT	A6NFD8	242 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	IFNA10	P01566	189 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	MFF	Q9GZY8	342 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261		U3KQ87	197 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	TOMM40	O96008	361 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	IL4	P05112	153 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	SPP1	P10451	314 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	SLC25A6	P12236	298 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KLHDC4-208	ENST00000562261	VAMP1	P23763	118 aa		11.07	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.6 ms