RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 FBXL15Q9H469 300 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 MED9Q9NWA0 146 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 PEMTQ9UBM1 199 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0J9YWU9 116 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 TEX22C9J3V5 150 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 E7EUB6 86 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 MPDU1O75352 247 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 CA2P00918 260 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA5P01569 189 aa7□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 RPEL1Q2QD12 228 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 KLK9Q2XQG4 91 aa7□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM217Q8N7C4 229 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 OR1L6Q8NGR2 347 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 OR2K2Q8NGT1 345 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 UQCC1Q9NVA1 299 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 KLK9Q9UKQ9 250 aa7□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM68Q96MH6 324 aa6.99□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.98□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 LFNGQ8NES3 379 aa6.98□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 TMED6Q8WW62 240 aa6.98□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 HINT2Q9BX68 163 aa6.98□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.98□□□□□ -1.29
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 CYB5BO43169 146 aa6.96□□□□□ -1.3
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