RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-209	ENST00000559551	RND2	P52198	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ELOB	Q15370	118 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TEPP	Q6URK8	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	RARRES2	Q99969	163 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		B4DEV8	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		M0QZK8	103 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	NDUFB8	O95169	186 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGF1	P05019	195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	LINC00869	P0C866	280 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	THAP8	Q8NA92	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ESM1	Q9NQ30	184 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	MPDU1	O75352	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR10J1	P30954	320 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PKIA	P61925	76 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRR20E	P86478	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRR20C	P86479	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRR20D	P86480	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRR20B	P86481	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRR20A	P86496	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		Q8WTZ3	238 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	F8	P00451	2351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	CORT	O00230	105 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR2J3	O76001	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HBE1	P02100	147 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SERF2	P84101	59 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM160	Q9NX00	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TSTD3	H0UI37	97 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BK	O60814	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BO	P23527	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BB	P33778	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BD	P58876	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BC	P62807	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF90	Q03938	601 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TEX29	Q8N6K0	151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		A0A1B0GV50	99 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	CFHR3	Q02985	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	C14orf144	Q96I85	54 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	CXCL1	P09341	107 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	CCL20	P78556	96 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	ICAM4	Q14773	271 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	KHDC3L	Q587J8	217 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	CYB5B	O43169	146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR4X1	Q8NH49	305 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM68	Q96MH6	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RABGGTA-209	ENST00000559551	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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