RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 LYZP61626 148 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 HBG1P69891 147 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 HBG2P69892 147 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 RGS21Q2M5E4 152 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 LILRB2Q8N423 598 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 RNF2Q99496 336 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 ASCL2Q99929 193 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 ZMAT4Q9H898 229 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 C7orf66A4D0T2 115 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 ZNF785A8K8V0 405 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 K7EPK0 472 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 TSPAN4O14817 238 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 SIX6O95475 246 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 IGKV1-17P01599 117 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 PSG1P11464 419 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 TRGV9Q99603 122 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 B9D2Q9BPU9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 MED28Q9H204 178 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-208ENST00000462335 E5RGE8 158 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 DFFBO76075 338 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 CST7O76096 145 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ORM2P19652 201 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 P2RY1P47900 373 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 RAP2BP61225 183 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SELENOTP62341 195 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 DLK1P80370 383 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ZNF90Q03938 601 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 RAB32Q13637 225 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 TEPPQ6URK8 271 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ST8SIA2Q92186 375 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 RNF125Q96EQ8 232 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 GGACTQ9BVM4 153 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 NMES1Q9C002 83 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 FBXL17Q9UF56 701 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 RNF24Q9Y225 148 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 DEDDO75618 318 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 CD7P09564 240 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 OR5G3P0C626 314 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 CRYBB3P26998 211 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 S100A11P31949 105 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 DEFB125Q8N687 156 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 THAP6Q8TBB0 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ALG5Q9Y673 324 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 FNDC10F2Z333 226 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 HYPMO75409 117 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SULT1A1P50225 295 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 PAX9P55771 341 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 BAXQ07812 192 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ATP6V1FQ16864 119 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZRG5 221 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ZNF546Q86UE3 836 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 Q8N1Y9 231 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 STPG3Q8N7X2 389 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ZNF709Q8N972 641 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 THAP8Q8NA92 274 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 VSIRQ9H7M9 311 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A22Q9H936 323 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ID1P41134 155 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 GALR1P47211 349 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 APOC4P55056 127 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 ARL6Q9H0F7 186 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKP4-208ENST00000462335 DOK5Q9P104 306 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.1 ms