RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	AZU1	P20160	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	AADAC	P22760	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	REG1B	P48304	166 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF134	P52741	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IFITM3	Q01628	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HES1	Q14469	280 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF79	Q15937	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	1e-8	■■■■■ 31.1
ECHDC1-208	ENST00000436638	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TIMM23	O14925	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSN3	P07498	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	THBS3	P49746	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DYNLT3	P51808	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF137P	P52743	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HILS1	P60008	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC35B1	P78383	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CATR1	Q13166	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	LY6E	Q16553	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PPI3	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PRE2	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHOX2A	O14813	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MOS	P00540	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ESD	P10768	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSG1	P11464	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	GYPE	P15421	78 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAS2R31	P59538	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RHOG	P84095	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RUNX1	Q01196	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MSMO1	Q15800	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms