RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	DHODH	Q02127	395 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM17	Q86X19	198 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR146	Q96CH1	333 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM56	Q96MV1	263 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	COMMD9	Q9P000	198 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A096LPF7	62 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0J9YX75	114 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIVA1	O15304	175 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	BUB3	O43684	328 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNAPC5	O75971	98 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	NXPH3	O95157	252 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	NXPH4	O95158	308 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGF2	P09038	288 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTXN2	P0C2S0	81 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	GADD45A	P24522	165 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRCD	Q00LT1	54 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	CATR1	Q13166	79 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	SSX1	Q16384	188 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	HACD4	Q5VWC8	232 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPRA1	Q86W33	373 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q9H521	79 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651		V9GY05	133 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NIF3L1-206	ENST00000416651	IRGM	A1A4Y4	181 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651		J3KRW8	73 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAS8-AS1	O95177	125 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	HTN1	P15515	57 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	F2R	P25116	425 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERVK-16	P61578	105 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	FABP5	Q01469	135 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRND	Q9UKY0	176 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651		A8MTW9	85 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNAO1	P09471	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLC1	P0CG04	106 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	M6PR	P20645	277 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	WFDC2	Q14508	124 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZSA8	131 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4X1	Q8NH49	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYGB	Q8WWM9	190 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC22A	Q96IW7	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE7	O76087	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL4	P05112	153 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	MSMO1	Q15800	293 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	BEST4	Q8NFU0	473 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL22RA2	Q969J5	263 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLK11	Q9UBX7	282 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFITM5	A6NNB3	132 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPO	P30536	169 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPRK1	P41145	380 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	ETV6	P41212	452 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	RANBP1	P43487	201 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	RND2	P52198	227 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNG2	P59768	71 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARPC4	P59998	168 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4A16	Q8NH70	328 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NIF3L1-206	ENST00000416651	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49

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