RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409915.8

SF3B1-202, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SF3B1, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-202ENST00000409915 TAS2R31P59538 309 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 KRTAP10-2P60368 255 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 SLC35B1P78383 322 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 CCL8P80075 99 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 HSD52Q0P140 79 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 PSG7Q13046 419 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 BATFQ16520 125 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 TAL2Q16559 108 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GLYATL3Q5SZD4 288 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 OTOSQ8NHW6 89 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 Q8TCH9 128 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 DCUN1D4Q92564 292 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GPR82Q96P67 336 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 AGMATQ9BSE5 352 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 Q9HAA7 133 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 PSG8Q9UQ74 426 aa3.65□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 A0A096LNT2 108 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 H3BSH0 61 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GAGE7O76087 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 IGHV1-46P01743 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 HLA-DRB1P01911 266 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GAGE12FP0CL80 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GAGE12GP0CL81 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GAGE12IP0CL82 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 FUT3P21217 361 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 COL8A2P25067 703 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ATP6V0CP27449 155 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 S100GP29377 79 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 S100A10P60903 97 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GAGE4Q13068 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GAGE5Q13069 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GAGE6Q13070 117 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GGTLC2Q14390 218 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GNMTQ14749 295 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ICAM4Q14773 271 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 CDK5R1Q15078 307 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 PSG5Q15238 335 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ARL9Q6T311 187 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 Q6ZR03 302 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 TMEM219Q86XT9 240 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 OR8B12Q8NGG6 310 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 SPTSSAQ969W0 71 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GALMQ96C23 342 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 OR10C1Q96KK4 312 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 C17orf77Q96MU5 243 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 P2RX4Q99571 388 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ERG28Q9UKR5 140 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.64□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ZFHX3Q15911 3703 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 H0Y980 276 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 CDK2AP2O75956 126 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 HBE1P02100 147 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 MAS1P04201 325 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 LINC00869P0C866 280 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 PTHLHP12272 177 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 ALOX5APP20292 161 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 OMGP23515 440 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 REG1BP48304 166 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GNG4P50150 75 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 RND3P61587 244 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GNB2P62879 340 aa3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SF3B1-202ENST00000409915 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
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