RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 SIX6O95475 246 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 S100A10P60903 97 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF90Q03938 601 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 C19orf73Q9NVV2 129 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 H2BFSP57053 126 aa15.27■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 LILRB2Q8N423 598 aa15.27■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 RNF125Q96EQ8 232 aa15.27■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CLDN3-201ENST00000395145 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 AKR1C1Q04828 323 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 GGACTQ9BVM4 153 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 ALG5Q9Y673 324 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 COL7A1Q02388 2944 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 DEDDO75618 318 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 BCAP31P51572 246 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 CAV2P51636 162 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 ARL16Q0P5N6 197 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 TCF24Q7RTU0 167 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 RABAC1Q9UI14 185 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 OR4C46A6NHA9 309 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 DFFBO76075 338 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 P2RY1P47900 373 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 RGS21Q2M5E4 152 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 GRAMD2BQ96HH9 432 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 SMCO3A2RU48 225 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 OR11H12B2RN74 326 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 TRAV2A0A0B4J234 112 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 RLN2P04090 185 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 OR2F1Q13607 317 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 C16orf54Q6UWD8 224 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 DEFB125Q8N687 156 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 GLMPQ8WWB7 406 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 TUBA4BQ9H853 241 aa15.22■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 IGSF23A1L1A6 192 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 BUB3O43684 328 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 CST7O76096 145 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 SULT1A1P50225 295 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 LYZP61626 148 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 PAFAH1B2P68402 229 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.21■□□□□ 0.03
CLDN3-201ENST00000395145 E5RGE8 158 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 H0YIZ8 118 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 SELENOTP62341 195 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 OXA1LQ15070 435 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 TEPPQ6URK8 271 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 STX12Q86Y82 276 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 SBSPONQ8IVN8 264 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 MS4A6AQ9H2W1 248 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.2■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 HELTA6NFD8 242 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 S100A11P31949 105 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 VWC2Q2TAL6 325 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 GBGT1Q8N5D6 347 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM217Q8N7C4 229 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 ASCL2Q99929 193 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.19■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 PET100P0DJ07 73 aa15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 CXCL3P19876 107 aa15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 TFPI2P48307 235 aa15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 HBG1P69891 147 aa15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 HBG2P69892 147 aa15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 C1orf194Q5T5A4 169 aa15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 STPG3Q8N7X2 389 aa15.18■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CLDN3-201ENST00000395145 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms