RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TSKUQ8WUA8 353 aa16.37■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 IFI27L2Q9H2X8 130 aa16.37■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 ONECUT1Q9UBC0 465 aa16.37■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 PMCHL1Q16048 86 aa16.37■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 C19orf35Q6ZS72 473 aa16.37■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 CIDEAO60543 219 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 P0C879 139 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 DLX1P56177 255 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 BRWD1-AS2P59051 145 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00205P59089 165 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 IGLL1P15814 213 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 Q56UQ5 140 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 PRR27Q6MZM9 219 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 ZNRD1Q9P1U0 126 aa16.36■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 PAX2Q02962 417 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 MBD6Q96DN6 1003 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 TP73-AS1Q9UF72 201 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 RBP4P02753 201 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 MT-ND6P03923 174 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 REG1AP05451 166 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 WDR73Q6P4I2 378 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 FAM216AQ8WUB2 273 aa16.35■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 OR2T8A6NH00 312 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 MPV17L2Q567V2 206 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 Q8N7P7 452 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 V9GYV3 84 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 MED13LQ71F56 2210 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 ENSAO43768 121 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 TCL1AP56279 114 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 ARF6P62330 175 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
UBE2B-201ENST00000265339 K7ERU9 68 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 BMPR1BO00238 502 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 TAX1BP3O14907 124 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A16P16260 332 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 GPR12P47775 334 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 TXNDC17Q9BRA2 123 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM133Q9H2Q1 129 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 UNC79Q9P2D8 2635 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 RRHO14718 337 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 PROP1O75360 226 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 FOXH1O75593 365 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 VWC2Q2TAL6 325 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 WASHC3Q9Y3C0 194 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 RIPPLY3P57055 190 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 CATR1Q13166 79 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 RPL39P5Q59GN2 51 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 Q5PR19 223 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB34Q8NCN2 500 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 OR4P4Q8NGL7 312 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 M0R1W7 72 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 CX3CL1P78423 397 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 A0A096LNT2 108 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 RHOBP62745 196 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD12Q8N2K0 398 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 KIR3DL3Q8N743 410 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 HECTD1Q9ULT8 2610 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 J3QR06 171 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 TOX4O94842 621 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 USF1P22415 310 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 FXYD3Q14802 87 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM12Q96EX1 92 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00473A8K010 186 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 CXorf1O96002 111 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 CD1BP29016 333 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 OR9G1Q8NH87 305 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 H0YJW9 148 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 RAB29O14966 203 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 STAG3L2P0CL84 134 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 STAG3L3P0CL85 134 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 WDR83OSQ9Y284 106 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 GAGE12BA1L429 117 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 NUDT3O95989 172 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00311Q8N616 119 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2B-201ENST00000265339 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms