RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 TGP01266 2768 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 GOSR2O14653 212 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SIX6O95475 246 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SLC25A4P12235 298 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 OR10J1P30954 320 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 RAB11AP62491 216 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 GAMTQ14353 236 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 NOXA1Q86UR1 476 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 PSENENQ9NZ42 101 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ZNF785A8K8V0 405 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 K7EMT4 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 K7EPK0 472 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 PRAF2O60831 178 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 CD7P09564 240 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 GUCA2BQ16661 112 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 Q8N1Y9 231 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ST8SIA2Q92186 375 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 MARC2Q969Z3 335 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SLC35E1Q96K37 410 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 C2orf50Q96LR7 162 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 C7orf66A4D0T2 115 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 CHEK1O14757 476 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 PTTG1O95997 202 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 CD81P60033 236 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 S100A10P60903 97 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ZNF90Q03938 601 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 ARL16Q0P5N6 197 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IL15RAQ13261 267 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 RAB32Q13637 225 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SMIM8Q96KF7 97 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 RNF2Q99496 336 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 GINS3Q9BRX5 216 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SMPXQ9UHP9 88 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-211ENST00000548041 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 SMCO3A2RU48 225 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 ZFP92A6NM28 416 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 TSC22D2O75157 780 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 SCGB2A1O75556 95 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 TOMM40O96008 361 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 IL4P05112 153 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 PSG1P11464 419 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 H2BFSP57053 126 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 AKR1C1Q04828 323 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 LILRB2Q8N423 598 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 RAB40CQ96S21 281 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 NEURL2Q9BR09 285 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 ALG5Q9Y673 324 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 L7N2F9 121 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 SSNA1O43805 119 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 RD3LP0DJH9 198 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 CRYBB3P26998 211 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 TAS2R30P59541 319 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 VAMP2P63027 116 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 OR2F1Q13607 317 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-211ENST00000548041 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 236.7 ms