RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 LYZL4Q96KX0 146 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TM2D2Q9BX73 214 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 MYO7BQ6PIF6 2116 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 RP1P56715 2156 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 NCKAP5O14513 1909 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A0G2JRQ6 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GAGE12JA6NER3 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 H3BP45 60 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FOXH1O75593 365 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GAGE7O76087 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-5P01602 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CLPSP04118 112 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SPINK8P0C7L1 97 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZNF883P0CG24 379 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GAGE12FP0CL80 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GAGE12GP0CL81 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GAGE12IP0CL82 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 G6PCP35575 357 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GAGE4Q13068 117 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 MFAP5Q13361 173 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PCSK4Q6UW60 755 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZRM9 215 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZNF611Q8N823 705 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GATD1Q8NB37 220 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SAP25Q8TEE9 199 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CT55Q8WUE5 264 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.86□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 hDV102S1A0JD36 115 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CLDN14O95500 239 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-39P01597 117 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 STATHP02808 62 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1D-39P04432 117 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 P04436 131 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IAPPP10997 89 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PVRP15151 417 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ASIPP42127 132 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FGF12P61328 243 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 HBBP68871 147 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PMP22Q01453 160 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FOXI1Q12951 378 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CATR1Q13166 79 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CENPWQ5EE01 88 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PIP4P1Q86T03 277 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A45Q8N413 288 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TEX29Q8N6K0 151 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OR51H1Q8NH63 302 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OR10G6Q8NH81 332 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PIGTQ969N2 578 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OXGR1Q96P68 337 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CEP250Q9BV73 2442 aa5.85□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 MED12LQ86YW9 2145 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LMO7DNF2Z398 122 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 H0YIG0 161 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 M0R135 149 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CRYAAP02489 173 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGKV3-11P04433 115 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 EVI2AP22794 236 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SLC35B1P78383 322 aa5.84□□□□□ -1.47
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