RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS5O15539 181 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABARAPO95166 117 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHFRP00374 187 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPRT1P00492 218 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-48P01763 117 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFC1BP0CG36 223 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFC1P0CG37 223 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR13C7P0DN81 318 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOLR2P14207 255 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTRB1P17538 263 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNRHRP30968 328 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS3P35030 304 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCVRNP35243 200 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPAR6P43657 344 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKR1C2P52895 323 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFAP2P55001 183 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R31P59538 309 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN5P62079 268 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 WT1-ASQ06250 92 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR107Q5VW38 600 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q8N402 240 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUC7Q8TAX7 377 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 ISOC1Q96CN7 298 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAC1Q96KF2 57 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLXQ9UH92 298 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 KMT2AQ03164 3969 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf61A6NNL5 157 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MWP6 167 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0Y980 276 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV1-39P01597 117 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOA1P02647 267 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD3DP04234 171 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV1D-39P04432 117 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 F2RP25116 425 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAS1LP35410 378 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPCS2Q15005 226 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSMO1Q15800 293 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAGHQ16775 308 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TATDN3Q17R31 274 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM16LQ309B1 348 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF876PQ49A33 203 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q56UQ5 140 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR141Q7Z602 305 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4A5Q8NH83 315 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPX8Q8TED1 209 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK11Q9UBX7 282 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0G2JRQ6 117 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 A4D1N5 150 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR11H12B2RN74 326 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS46E5RG02 174 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST8SIA3O43173 380 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGOLN2O43493 480 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK2AP2O75956 126 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNAPC5O75971 98 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRI3O95415 125 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.3 ms