RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ASB13Q8WXK3 278 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CXorf58Q96LI9 332 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 UFC1Q9Y3C8 167 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SLC22A5O76082 557 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HRASP01112 189 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CTXN2P0C2S0 81 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR4E1P0C645 316 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CXCL3P19876 107 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 S100A1P23297 94 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 RAP2BP61225 183 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 WT1-ASQ06250 92 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 POU2AF1Q16633 256 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 RNF151Q2KHN1 245 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 Q5BKY6 102 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR4A5Q8NH83 315 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 EHFQ9NZC4 300 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DNAH2Q9P225 4427 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 K7EIM0 57 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB4AO15263 64 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 PGAM2P15259 253 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 AKR1C4P17516 323 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FGL1Q08830 312 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM128Q5BJH2 165 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 GALNT14Q96FL9 552 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 C16orf92Q96LL3 132 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 RNF2Q99496 336 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM140Q9NV12 185 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FBXL17Q9UF56 701 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 K7EMT4 169 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFA4O00483 81 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 CHEK1O14757 476 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 PPYP01298 95 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINE2P07093 398 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 OR13C7P0DN81 318 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 FCGR2CP31995 323 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TFPI2P48307 235 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 MARCH1Q8TCQ1 289 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 RARRES2Q99969 163 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 C20orf24Q9BUV8 137 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 CSTL1Q9H114 145 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 COMMD9Q9P000 198 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 SMPXQ9UHP9 88 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 APLNQ9ULZ1 77 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 NSG2Q9Y328 171 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 HSPB11Q9Y547 144 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 RYR1P21817 5038 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf170A2RU37 121 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 OR4C46A6NHA9 309 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 GOSR2O14653 212 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 HPRT1P00492 218 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 CTSGP08311 255 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 NQO2P16083 231 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 S100GP29377 79 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 FXYD4P59646 89 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 HERV-K104P61576 105 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 DHRS2Q13268 280 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXD8-202ENST00000429017 MSMO1Q15800 293 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms