RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLK1P80370 383 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSG9Q00887 426 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIGITQ495A1 244 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EHFQ9NZC4 300 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAT1Q14517 4588 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5G1P05496 136 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB130BP0DP73 79 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB130AP0DP74 79 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ID1P41134 155 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5G3P48201 142 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC35G3Q8N808 338 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C17orf77Q96MU5 243 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP21Q9H596 190 aa11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0QYG6 137 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FCER2P06734 321 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF79Q15937 498 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINK9Q5DT21 86 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF141Q8WVD5 230 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00052Q96N35 136 aa11.5□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0A6YYH2 397 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM30A4D0T7 59 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A6NJ64 397 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BUB3O43684 328 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA5P01569 189 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C22orf42Q6IC83 251 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COQ8AQ8NI60 647 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UPK3BQ9BT76 320 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MDFICQ9P1T7 246 aa11.49□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBY3A6NI87 242 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL4P05112 153 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB3P49720 205 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RORCP51449 518 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB1P60022 68 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHODHQ02127 395 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLANAQ16655 118 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZSN1 163 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS48Q7RTY5 328 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFT46Q9NQC8 304 aa11.48□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1-39P01597 117 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1D-39P04432 117 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLC1P0CG04 106 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPOP30536 169 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RFX2P48378 723 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA13P48723 471 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAX9P55771 341 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCAND1P57086 179 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ICAM4Q14773 271 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM78BQ5VT40 261 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABHD1Q96SE0 405 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ENY2Q9NPA8 101 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.47□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10J1P30954 320 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVFC1-1P60608 527 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B2MP61769 119 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHLDA2Q53GA4 152 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYT8Q8NBV8 401 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FXYD6Q9H0Q3 95 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VCXQ9H320 206 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIABLOQ9NR28 239 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLK11Q9UBX7 282 aa11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A4P12235 298 aa11.45□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB9P28065 219 aa11.45□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R46P59540 309 aa11.45□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.45□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.45□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF503Q96F45 646 aa11.45□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0J9YX75 114 aa11.44□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.44□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RND2P52198 227 aa11.44□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00315P59091 139 aa11.44□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms