RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 M0QZ24 198 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF841Q6ZN19 808 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 IGLL1P15814 213 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 PATE2Q6UY27 113 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 DEFB123Q8N688 67 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00574Q9H8X3 128 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 RPH3ALQ9UNE2 315 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 DLL1O00548 723 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 ERHP84090 104 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 NPIPB3Q92617 1050 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 C22orf34Q6ZV56 151 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 OR2D3Q8NGH3 330 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 CACNG8Q8WXS5 425 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 DYSFO75923 2080 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 C10orf113Q5VZT2 155 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 GRAMD2BQ96HH9 432 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 TM4SF5O14894 197 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 DEFB109BQ30KR1 87 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 SAP30LQ9HAJ7 183 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 TCF24Q7RTU0 167 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 BLNKQ8WV28 456 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 UBE2G1P62253 170 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 hADV38S2A0JD32 116 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 C2orf70A6NJV1 201 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 CCL3L1P16619 93 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 OR8B3Q8NGG8 313 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF714Q96N38 554 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 OR8B2Q96RD0 313 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 M0R296 226 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 APOA2P02652 100 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 FAM231DQ6ZW35 169 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 H0YJW9 148 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 CCL8P80075 99 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 WT1-ASQ06250 92 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa21.83■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ERASQ7Z444 233 aa21.83■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ORAOV1Q8WV07 137 aa21.83■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 FXYD5Q96DB9 178 aa21.83■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 RASL11AQ6T310 242 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 BDP1A6H8Y1 2624 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 KALRNO60229 2985 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 OR4F17Q8NGA8 305 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ASCL3Q9NQ33 180 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 FAM215AQ9Y5M1 114 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00312Q9Y6C7 94 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 CGB1A6NKQ9 187 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 H3BTX0 84 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 COX11Q9Y6N1 276 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 TNFSF4P23510 183 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 FAM27E3Q08E93 113 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00173Q6ZV60 143 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00305Q7Z4B0 112 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 C7orf69Q9H7B7 122 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 MOSP00540 346 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ORM2P19652 201 aa21.79■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 OR5AN1Q8NGI8 311 aa21.79■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 OR1L4Q8NGR5 311 aa21.79■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 MGAQ8IWI9 3026 aa21.79■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 OR2J3O76001 311 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 FSTL3O95633 263 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM30BQ3MIR4 351 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM177Q53S58 311 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 TEX36Q5VZQ5 186 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF738Q8NE65 137 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 PKDREJQ9NTG1 2253 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 LEMD1Q68G75 181 aa21.77■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 SSX8Q7RTT4 187 aa21.77■■□□□ 1.08
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF596Q8TC21 504 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms