RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		5.7	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.7	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		5.7	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		A0A1B0GXF2	115 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	FAM231B	A6NCW3	169 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR4C46	A6NHA9	309 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		B5MCH6	92 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR7C2	O60412	319 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	NUDT3	O95989	172 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	HAND1	O96004	215 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	NGF	P01138	241 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	PATE4	P0C8F1	98 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	GDF1	P27539	372 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	MLF1	P58340	268 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	PSG9	Q00887	426 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	PLP2	Q04941	152 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	RBPJ	Q06330	500 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR1C1	Q15619	314 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	MPV17L2	Q567V2	206 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	NEUROG1	Q92886	237 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	RARRES3	Q9UL19	164 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	ACACA	Q13085	2346 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		A0A1W2PR80	420 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		A0A1W2PRX2	142 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	TMEM189	A5PLL7	270 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	C12orf77	C9JDV5	145 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		M0QZ24	198 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	HBZ	P02008	142 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		P04436	131 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	LIPF	P07098	398 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR9G9	P0C7N8	305 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	COX8A	P10176	69 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	NTF3	P20783	257 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	BMI1	P35226	326 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	POU2AF1	Q16633	256 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	ZNF766	Q5HY98	468 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	LCN12	Q6JVE5	192 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR4A16	Q8NH70	328 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SMPX	Q9UHP9	88 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		5.68	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	MAST4	O15021	2626 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	C5orf49	A4QMS7	147 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	HSPB6	O14558	160 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	KLK10	O43240	276 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	CXCL13	O43927	109 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SCRG1	O75711	98 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	C8orf88	P0DMB2	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	CCL3	P10147	92 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	GPR183	P32249	361 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SSTR5	P35346	364 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	CA7	P43166	264 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	SLA	Q13239	276 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		Q56UQ5	140 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	XP32	Q5T750	250 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZVH6	145 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	GATD1	Q8NB37	220 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	NUP35	Q8NFH5	326 aa		5.67	□□□□□ -1.5
USP7-217	ENST00000567329	OR10D3	Q8NH80	312 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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