RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 MSGN1A6NI15 193 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 G3V318 75 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 H7C2Y5 167 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 UPK2O00526 184 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SHOXO15266 292 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 KBTBD11O94819 623 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CNIH1O95406 144 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 BRI3O95415 125 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM50AO95807 157 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB1D2O95969 90 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV2-23P01705 113 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR9G9P0C7N8 305 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TEX261Q6UWH6 196 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N6K4 173 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR4A16Q8NH70 328 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 U3KQ87 197 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PN81 502 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ATP6V0E1O15342 81 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 SSSCA1O60232 199 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV1-40P01703 118 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 CRYGBP07316 175 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 MAS1LP35410 378 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 CHRNA7P36544 502 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 F2RL1P55085 397 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 VAMP2P63027 116 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 MMDQ15546 238 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ECSCRQ19T08 205 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 LCN12Q6JVE5 192 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 NPBQ8NG41 125 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 DTD1Q8TEA8 209 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFA3O95167 84 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-11P01762 117 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 HTR2BP41595 481 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 SULT1A1P50225 295 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 CAV2P51636 162 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 PRCDQ00LT1 54 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 SSX9Q7RTT3 188 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 STX12Q86Y82 276 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ARV1Q9H2C2 271 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 RBKSQ9H477 322 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 IGSF23A1L1A6 192 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA17P01571 189 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ZP3P21754 424 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 CD81P60033 236 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF266Q14584 549 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 PSG5Q15238 335 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 BSXQ3C1V8 233 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 MMD2Q8IY49 270 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.06□□□□□ -1.28
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SMAD3-215ENST00000560424 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 PSENENQ9NZ42 101 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 FBXL17Q9UF56 701 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.06□□□□□ -1.28
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SMAD3-215ENST00000560424 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00862A6NCI5 91 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 DFFBO76075 338 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 MED14OSP0DP75 135 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 TPPP2P59282 170 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 OR2B8PP59922 312 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 HBG1P69891 147 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-215ENST00000560424 HBG2P69892 147 aa7.05□□□□□ -1.28
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