RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 GPX1P07203 203 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ACP1P24666 158 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ARR3P36575 388 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CEACAM3P40198 252 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 REG1BP48304 166 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 GNG10P50151 68 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 FXYD4P59646 89 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 UBE2G2P60604 165 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 LMO4P61968 165 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 RHOBP62745 196 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ARG2P78540 354 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZSR6 202 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CALHM1Q8IU99 346 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 GCNT2Q8N0V5 402 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TMEM186Q96B77 213 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 BORCS8Q96FH0 119 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 VAMP8Q9BV40 100 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 PSENENQ9NZ42 101 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 IL36BQ9NZH7 164 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 PCDH15Q96QU1 1955 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 GTF3C1Q12789 2109 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 A0A0U1RRA0 63 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TMEM89A2RUT3 159 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CDIPTO14735 213 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ANGPTL7O43827 346 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 RAMP3O60896 148 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF253O75346 499 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 MPDU1O75352 247 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 HYPMO75409 117 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR2J2O76002 312 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 STAG3L2P0CL84 134 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 STAG3L3P0CL85 134 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 COX5AP20674 150 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OMGP23515 440 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 S100GP29377 79 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 PRRX1P54821 245 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR5I1Q13606 314 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 PMCHL1Q16048 86 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 PIGYQ3MUY2 71 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TDRG1Q3Y452 100 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 RASL11AQ6T310 242 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 REG3GQ6UW15 175 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 MUC15Q8N387 334 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 WDR31Q8NA23 367 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 NAT6Q93015 286 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TMEM45BQ96B21 275 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SFRP2Q96HF1 295 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR4F4Q96R69 305 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SIRPDQ9H106 197 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GX78 115 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 FNDC10F2Z333 226 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 F5H5K5 113 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 H0YJW9 148 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SIRPB1O00241 398 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 RAB29O14966 203 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TCF21O43680 179 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SERF1AO75920 110 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 IGHG3P01860 377 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 HLA-DRB1P01911 266 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SCTP09683 121 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 277.3 ms