RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 NPBWR1P48145 328 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 CD81P60033 236 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R1AQ13522 171 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 C2orf83Q53S99 150 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 BTNL8Q6UX41 500 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 LRTM2Q8N967 370 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 NEURL2Q9BR09 285 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 A6NHS1 94 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 BTCP35070 178 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 OPRK1P41145 380 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TNFRSF9Q07011 255 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 OR4X1Q8NH49 305 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 OR1S1Q8NH92 325 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 OR10C1Q96KK4 312 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RBKSQ9H477 322 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TUBA4BQ9H853 241 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.88□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 C9orf170A2RU37 121 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 PLA2G10O15496 165 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 PITX3O75364 302 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 CLN5O75503 358 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 IFNA10P01566 189 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 HOXB5P09067 269 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 NOXA1Q86UR1 476 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 DEFB125Q8N687 156 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 DTD1Q8TEA8 209 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SMPXQ9UHP9 88 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 U3KQ87 197 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 U3KQK5 164 aa6.87□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 OR11H12B2RN74 326 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 CHEK1O14757 476 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 OR4E1P0C645 316 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A6P12236 298 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 NPY1RP25929 384 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ZMAT4Q9H898 229 aa6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TSPAN4O14817 238 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 LYRM1O43325 122 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SCGB2A1O75556 95 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ADAP1O75689 374 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A4P12235 298 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 DHRS2Q13268 280 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 HAGHQ16775 308 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TIGITQ495A1 244 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 LYG2Q86SG7 212 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 COQ8AQ8NI60 647 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RNF2Q99496 336 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 GINS3Q9BRX5 216 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 CCDC32Q9BV29 185 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 SORL1Q92673 2214 aa6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.84□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.84□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 MPTX1A8MV57 137 aa6.84□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 MED6O75586 246 aa6.84□□□□□ -1.31
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1-17P01599 117 aa6.84□□□□□ -1.31
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