RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 SLC35E1Q96K37 410 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 A0A1W2PPI3 338 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 MOSP00540 346 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 GRNP28799 593 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 MMD2Q8IY49 270 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TRAV34A0A0B4J273 112 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 DLL1O00548 723 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 MT-CO2P00403 227 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 SGK494Q96LW2 274 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 DYNLRB1Q9NP97 96 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 C9JCJ5 164 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 FNDC10F2Z333 226 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 FAM87AP0C7U9 286 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 MFAP2P55001 183 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 OR5AU1Q8NGC0 362 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 OR4C13Q8NGP0 309 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 FAM168AQ92567 244 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TMEM18Q96B42 140 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 MGST1P10620 155 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 FOXC1Q12948 553 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 LRRC10Q5BKY1 277 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 C8orf88P0DMB2 117 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 ERHP84090 104 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 SPACA3Q8IXA5 215 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 LINC01560Q8TB33 94 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TMEM167BQ9NRX6 74 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 SNURFLB1AK76 121 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 C22orf46C9J442 243 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TSTD3H0UI37 97 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 IGHV1-8P0DP01 117 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 RNF114Q9Y508 228 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 VPS13CQ709C8 3753 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GV90 55 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 H3BTX0 84 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 LY6HO94772 140 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 GNG5P63218 68 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TBR1Q16650 682 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 TMEM155Q4W5P6 130 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 LURAP1LQ8IV03 231 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 MED13LQ71F56 2210 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 FCN1O00602 326 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 SERF1AO75920 110 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 RPEL1Q2QD12 228 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 WASHC3Q9Y3C0 194 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-202ENST00000420808 A8MWP6 167 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 FSTL3O95633 263 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 SCGB1D1O95968 90 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 DNLZQ5SXM8 178 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 ASCL5Q7RTU5 278 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 ZNF835Q9Y2P0 537 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 GATCO43716 136 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 PAX1P15863 534 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 TMEM30BQ3MIR4 351 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 TDRG1Q3Y452 100 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 PDPNQ86YL7 162 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 MISP3Q96FF7 219 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 COL12A1Q99715 3063 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 SIAH2O43255 324 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 COX7A2P2O60397 106 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 GCGP01275 180 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 CDSNQ15517 529 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 LEMD1Q68G75 181 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZWC4 215 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 REC114Q7Z4M0 266 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 TMEM186Q96B77 213 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 SERTAD4Q9NUC0 356 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 ORM2P19652 201 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 CMTM2Q8TAZ6 248 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 COL6A6A6NMZ7 2263 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 CDKN1AP38936 164 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 TAS2R45P59539 299 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 BTF3L4Q96K17 158 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-202ENST00000420808 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
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