RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 TBPP20226 339 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 GNRHRP30968 328 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 KIR2DS2P43631 304 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 LPAR6P43657 344 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 INPP1P49441 399 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 NDPQ00604 133 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 TRIQKQ629K1 86 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 Q8N2B8 174 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 Q8N402 240 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 STPG2Q8N412 459 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 NPBQ8NG41 125 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 PHB2Q99623 299 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 CITED1Q99966 193 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR51J1Q9H342 316 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 MCUBQ9NWR8 336 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 A0A087X0K7 114 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 A0A1W2PN81 502 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 KBTBD11O94819 623 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 HRASP01112 189 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OPN1MWP04001 364 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF735P0CB33 412 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 VDAC1P21796 283 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 SLC35B1P78383 322 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 FXYD3Q14802 87 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-209ENST00000415046 PRSS8Q16651 343 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR4A47Q6IF82 309 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 LFNGQ8NES3 379 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR5T1Q8NG75 326 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 TERB2Q8NHR7 220 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 ARPC1AQ92747 370 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 SGK494Q96LW2 274 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR5B12Q96R08 314 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 SOSTQ9BQB4 213 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 HINT2Q9BX68 163 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 SRRQ9GZT4 340 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 COA4Q9NYJ1 87 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 COPZ2Q9P299 210 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 43.1
PTPRK-209ENST00000415046 ATP6V1G1O75348 118 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 OR2A4O95047 310 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 HPRT1P00492 218 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 KRASP01116 189 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 IGHV3-11P01762 117 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 CRYGBP07316 175 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 IL7P13232 177 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 AKR1C4P17516 323 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-209ENST00000415046 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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