RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407417.7

NFIA-208, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 2 BASIC

Gene NFIA, Length 2,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-208	ENST00000407417	OR11H2	Q8NH07	326 aa		7	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF799	Q96GE5	643 aa		7	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		7	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		7	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	CENPE	Q02224	2701 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	F2RL2	O00254	374 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SIVA1	O15304	175 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	CXCL13	O43927	109 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	IGKV1D-12	P01611	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR10D3	Q8NH80	312 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM45B	Q96B21	275 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OXGR1	Q96P68	337 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	HBZ	P02008	142 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	IGFBP2	P18065	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	HTR1D	P28221	377 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	BRICD5	Q6PL45	260 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417		Q8N7P7	452 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR1L1	Q8NH94	360 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	EMC6	Q9BV81	110 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR2D2	Q9H210	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417		A0A1W2PNR3	127 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417		A0A1W2PR80	420 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417		F5H5K5	113 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	TSPAN13	O95857	204 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SCT	P09683	121 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	EGR1	P18146	543 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	GNG4	P50150	75 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	TIGIT	Q495A1	244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	S100A7A	Q86SG5	101 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	C5orf30	Q96GV9	206 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417		A0A0G2JLM5	398 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417		P0C879	139 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	CDA	P32320	146 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	PPOX	P50336	477 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	RAC3	P60763	192 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	RTL8B	Q17RB0	113 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	PSMG4	Q5JS54	123 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	WDR31	Q8NA23	367 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR4A16	Q8NH70	328 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417		A0A1W2PPM0	123 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	LRRC30	A6NM36	301 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	LIPF	P07098	398 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	CRYGC	P07315	174 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	CRYGS	P22914	178 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	FGF12	P61328	243 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF585B	Q52M93	769 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	ERAS	Q7Z444	233 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	OR51H1	Q8NH63	302 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NFIA-208	ENST00000407417	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29

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