RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	CHRNA7	P36544	502 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFA6	P56556	154 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	GNB1	P62873	340 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	GAGE1	Q13065	139 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PSG5	Q15238	335 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	KCTD9	Q7L273	389 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	OR4S2	Q8NH73	311 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CLCC1	Q96S66	551 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	P2RX4	Q99571	388 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	VWF	P04275	2813 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873		H3BUA1	57 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	GABARAP	H6UMI1	98 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873		M0R143	59 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	MPPED1	O15442	326 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	DLEU1	O43261	78 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFB6	O95139	128 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CA2	P00918	260 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	RLN1	P04808	185 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	OR4E1	P0C645	316 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SFTA3	P0C7M3	94 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SLC25A4	P12235	298 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	FGF7	P21781	194 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	KIR2DS2	P43631	304 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TPPP2	P59282	170 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TAS2R46	P59540	309 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	HERV-K104	P61576	105 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	NDP	Q00604	133 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	RUNX1	Q01196	453 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF616	Q08AN1	781 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CATR1	Q13166	79 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	GAMT	Q14353	236 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	FXYD3	Q14802	87 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	MSMO1	Q15800	293 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	DEFB136	Q30KP8	78 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	RITA1	Q96K30	269 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PHB2	Q99623	299 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PLXNB1	O43157	2135 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0G2JLM5	398 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SMCO3	A2RU48	225 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873		M0R036	132 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PPP1R2P9	O14990	202 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	XRCC3	O43542	346 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	RAMP3	O60896	148 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	FCGR3B	O75015	233 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TUSC2	O75896	110 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	YIF1A	O95070	293 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	S100G	P29377	79 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	RAB9A	P51151	201 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	INSL3	P51460	131 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2K	P61086	200 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	FHL3	Q13643	280 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CLINT1	Q14677	625 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	MAJIN	Q3KP22	176 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	HOGA1	Q86XE5	327 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TEX45	Q8NA69	505 aa		5.36	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.3 ms