RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 MS4A6EQ96DS6 147 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 BBS2Q9BXC9 721 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPTCQ9UBM4 332 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 C10orf71Q711Q0 1435 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGF6P10767 208 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R60P59551 318 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELP6Q0PNE2 266 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPICQ8N5J4 248 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00301Q8NCQ3 95 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 BHLHE23Q8NDY6 225 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR8D4Q8NGM9 314 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6K2Q8NGY2 324 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM254Q8TBM7 123 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX47Q8TBZ9 253 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACOT13Q9NPJ3 140 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMC3Q9P0I2 261 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPATQ14207 1427 aa-3.78□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMCO3A2RU48 225 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT87PA6NCN2 255 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2B3O76000 313 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM33P57088 247 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB135Q30KP9 77 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASCL4Q6XD76 172 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 C9orf72Q96LT7 481 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF714Q96N38 554 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf21Q9H246 121 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRELID1Q9Y255 219 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYH10P35580 1976 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 FABP5P3A8MUU1 101 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 M0QYV0 167 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SULT1C4O75897 302 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSKP41240 450 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMF1Q6P1K2 205 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf82Q6UX34 121 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCD5Q86SK9 330 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAM1L1Q8N609 369 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 C20orf24Q9BUV8 137 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX10Q9Y5X0 201 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0D9SFI3 127 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 I3L521 148 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR171O14626 319 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 GATCO43716 136 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNCBQ16143 134 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPPA3Q6W0C5 159 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2W3Q7Z3T1 314 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q8IYB0 196 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 NECAB1Q8N987 351 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ISOC2Q96AB3 205 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPCDCQ96CD2 204 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPALINQ96PE5 141 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXorf21Q9HAI6 301 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAH8Q96JB1 4490 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0J9YY99 117 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCRIP1C9JLW8 97 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX7A2LO14548 114 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 FTH1P02794 183 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A7P31151 101 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 BATFQ16520 125 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ESRGQ1W209 222 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP157Q5JU67 520 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4A15Q8NGL6 344 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 BPESC1Q9GZL8 116 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARMC7Q9H6L4 198 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 C14orf132Q9NPU4 83 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLE3Q9NRF9 147 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOSPD1Q9UJG1 213 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSME2Q9UL46 239 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOPBP1Q92547 1522 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL24A1Q17RW2 1714 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0A6YYH2 397 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 A6NJ64 397 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA8RI6L899 631 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFNB1P01574 187 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC2A3P11169 496 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 GAP43P17677 238 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGT2B10P36537 528 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 DLX6P56179 175 aa-3.83□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms