RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508652.5

TMA16-205, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 2

Gene TMA16, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-205	ENST00000508652	CORT	O00230	105 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	S100A11	P31949	105 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SLC35B1	P78383	322 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	THYN1	Q9P016	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652		H3BUA1	57 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	PRH1	P02810	166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	CXCL2	P19875	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	MFAP2	P55001	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ATP6V1F	Q16864	119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SOX15	O60248	233 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	BRI3	O95415	125 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	IGHG4	P01861	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	C4BPB	P20851	252 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	CFHR3	Q02985	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF345	Q14585	488 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	KLK9	Q2XQG4	91 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	GGACT	Q9BVM4	153 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TAAR5	O14804	337 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	OR2J3	O76001	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TRGV3	P03979	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	PF4V1	P10720	104 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	OPRK1	P41145	380 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	DLK1	P80370	383 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	RHOG	P84095	191 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	DFFB	O76075	338 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	NDUFB8	O95169	186 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	MT-CO2	P00403	227 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ELANE	P08246	267 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	CD69	Q07108	199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	FOXE3	Q13461	319 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	CLINT1	Q14677	625 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	MLANA	Q16655	118 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMA16-205	ENST00000508652	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652		I3L2K1	104 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652		K7EIM0	57 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	RAB9A	P51151	201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	TPPP2	P59282	170 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMA16-205	ENST00000508652	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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