RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GU03	582 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS9	O00182	355 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CSN3	P07498	182 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N1Y9	231 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	BMPR1B	O00238	502 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A6	P12236	298 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS2	Q13268	280 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZRM9	215 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	NOXA1	Q86UR1	476 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CORT	O00230	105 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MED6	O75586	246 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB8	O95169	186 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXB5	P09067	269 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NMS	Q5H8A3	153 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR2B	P41595	481 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFA5	Q01523	94 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF9	Q07011	255 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ASCL2	Q99929	193 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL3	P36405	182 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MFAP4	P55083	255 aa		13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424		U3KQ87	197 aa		13.1	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MWP6	167 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAF2	O60831	178 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NXPH3	O95157	252 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA10	P01566	189 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	IL5	P05113	134 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC3B	P05452	202 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	IFITM3	Q01628	133 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424		Q56UQ5	140 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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