RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	PGAM2	P15259	253 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	8.86	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF2	Q99496	336 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	CTDSP2	O14595	271 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	ST8SIA3	O43173	380 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	UCP1	P25874	307 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	MFAP4	P55083	255 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	BSX	Q3C1V8	233 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	AARD	Q4LEZ3	155 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	TERB2	Q8NHR7	220 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	IL17D	Q8TAD2	202 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4C46	A6NHA9	309 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	GABARAP	H6UMI1	98 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB3D	O95716	219 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	TAS2R19	P59542	299 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	SP6	Q3SY56	376 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZRM9	215 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZWC4	215 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	AKR1C2	P52895	323 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TNFRSF9	Q07011	255 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF124	Q15973	351 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFB135	Q30KP9	77 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	LILRB2	Q8N423	598 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	VSIR	Q9H7M9	311 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		8.83	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GU03	582 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2C	O00762	179 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GNG7	O60262	68 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	YIF1A	O95070	293 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CDS2	O95674	445 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	APOC4	P55056	127 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR141	Q7Z602	305 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC35G3	Q8N808	338 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF183	Q96D59	192 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	COPZ2	Q9P299	210 aa		8.82	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0J9YWU9	116 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CTDSPL	O15194	276 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SPRY2	O43597	315 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	B3GALNT1	O75752	331 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM50A	O95807	157 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5AC1	P0C628	307 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ETV6	P41212	452 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	MLANA	Q16655	118 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TRIM16L	Q309B1	348 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	LYG2	Q86SG7	212 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ST8SIA2	Q92186	375 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GALNT14	Q96FL9	552 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR132	Q9UNW8	380 aa		8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	8.81	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	RGS5	O15539	181 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	JTB	O76095	146 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ATG12	O94817	140 aa		8.8	□□□□□ -1

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