RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	IRF2	P14316	349 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	BMP5	P22003	454 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ARG2	P78540	354 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	RASL11A	Q6T310	242 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TEPP	Q6URK8	271 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FAM168A	Q92567	244 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ATG101	Q9BSB4	218 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	CRYGB	P07316	175 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	GABRA2	P47869	451 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	OR5I1	Q13606	314 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TBR1	Q16650	682 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	MMD2	Q8IY49	270 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	C1RL	Q9NZP8	487 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897		A0A1W2PRE2	83 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf70	A6NJV1	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	GPR12	P47775	334 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	THBS3	P49746	956 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	CENPW	Q5EE01	88 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF575	Q86XF7	245 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	GCM1	Q9NP62	436 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	DLEU1	O43261	78 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SPINT2	O43291	252 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	LAMTOR5	O43504	91 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	CD46	P15529	392 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	NPY1R	P25929	384 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	RHOB	P62745	196 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	KCNS1	Q96KK3	526 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ABI3	Q9P2A4	366 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897		H0YJW9	148 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897		M0R143	59 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897		M0R1X1	148 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SLA	Q13239	276 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM177	Q53S58	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TSKU	Q8WUA8	353 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	MS4A10	Q96PG2	267 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FZR1	Q9UM11	496 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897		M0QZK8	103 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TM4SF5	O14894	197 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	NPS	P0C0P6	89 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	IGLC2	P0DOY2	106 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	IGLC3	P0DOY3	106 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	RAB7A	P51149	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	CD69	Q07108	199 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTSC-208	ENST00000533897	SMIM12	Q96EX1	92 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms