RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A14	Q9HCY8	104 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CTXN2	P0C2S0	81 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511		P0DMU3	169 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM231A	P0DMU4	169 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM231C	P0DMU5	169 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CD37	P11049	281 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SPHAR	Q15513	63 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZTC4	211 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF2	Q99496	336 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	GFI1	Q99684	422 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HRH4	Q9H3N8	390 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511		V9GY05	133 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		7.88	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf62	A8K5M9	175 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EMT4	169 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	MFNG	O00587	321 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF12	O43508	249 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DQB1	P01920	261 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HSMCR30	P0CW71	290 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2B8P	P59922	312 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK9	Q2XQG4	91 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HINT2	Q9BX68	163 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	BET1L	Q9NYM9	111 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SMPX	Q9UHP9	88 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC4	Q99102	2169 aa		7.87	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CGB1	A6NKQ9	187 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RTL8C	O15255	209 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	DTYMK	P23919	212 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF3	Q14653	427 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL6IP1	Q15041	203 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	LEMD1	Q68G75	181 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZS49	121 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF575	Q86XF7	245 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	STH	Q8IWL8	128 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF126	Q9BV68	326 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ETV7	Q9Y603	341 aa		7.86	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf61	A6NNL5	157 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGES3L	E9PB15	166 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CHEK1	O14757	476 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA10	P01566	189 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	MIF	P14174	115 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB131A	P59861	70 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ODF1	Q14990	250 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAM1	Q15629	374 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8NAQ8	132 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		7.85	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.84	□□□□□ -1.15

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