RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RANBP1P43487 201 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R31P59538 309 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM140Q9NV12 185 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC5AQ9NY25 188 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SULT1C2O00338 296 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 HPRT1P00492 218 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CD74P04233 296 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RAB6AP20340 208 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR10A3P58181 314 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CDNFQ49AH0 187 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SECTM1Q8WVN6 248 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ST8SIA2Q92186 375 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PTGES3LE9PB15 166 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ST8SIA3O43173 380 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IFNA21P01568 189 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IFNA17P01571 189 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 FABP5Q01469 135 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM41BQ5BJD5 291 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 HINT2Q9BX68 163 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa13.82□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 ERICH4A6NGS2 130 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 DMBX1Q8NFW5 382 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 OR1L8Q8NGR8 309 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa13.82□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 DCSTAMPQ9H295 470 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 VSIRQ9H7M9 311 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA10Q9UJ72 324 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 KNCNA6PVL3 124 aa13.81□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 SPP1P10451 314 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TNP2Q05952 138 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TRAM1Q15629 374 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 HACD4Q5VWC8 232 aa13.81□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.8□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 PTHLHP12272 177 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 SSX5O60225 188 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3-48P01763 117 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NPY1RP25929 384 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 FCGR2CP31995 323 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MFAP4P55083 255 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MSMO1Q15800 293 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP18Q8NEJ0 188 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 OR13F1Q8NGS4 319 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHA2Q9HB19 425 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NSG2Q9Y328 171 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 I3L2K1 104 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CATR1Q13166 79 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 OR51H1Q8NH63 302 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NACAE9PAV3 2078 aa13.78□□□□□ -0.2
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HOXD12-201ENST00000404162 MISP3Q96FF7 219 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TXN2Q99757 166 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GINS3Q9BRX5 216 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SLC5A7Q9GZV3 580 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PDCD5O14737 125 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PPYP01298 95 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF688P0C7X2 276 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 COMMD9Q9P000 198 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MT-CO2P00403 227 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GNG2P59768 71 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 RNF212Q495C1 297 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 OR1P1Q8NH06 330 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ACOT13Q9NPJ3 140 aa13.75□□□□□ -0.21
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