RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52I2	Q8NH67	350 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf58	Q96LI9	332 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200		M0QYG6	137 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC3B	P05452	202 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINE2	P07093	398 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FOLR2	P14207	255 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR141	Q7Z602	305 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	RCHY1	Q96PM5	261 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	NSG2	Q9Y328	171 aa		16.46	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	DBX1	A6NMT0	343 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13C7	P0DN81	318 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC22A	Q96IW7	307 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF785	A8K8V0	405 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MWP6	167 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1-39	P01597	117 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-39	P04432	117 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	S100G	P29377	79 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MFAP2	P55001	183 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SPCS2	Q15005	226 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	THYN1	Q9P016	225 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PRND	Q9UKY0	176 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		16.45	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM213	A2RRL7	107 aa		16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAPC5	O75971	98 aa		16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CD3D	P04234	171 aa		16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LAX1	Q8IWV1	398 aa		16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5B3	Q8NH48	314 aa		16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	16.44	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	C15orf61	A6NNL5	157 aa		16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TBP	P20226	339 aa		16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CBLN1	P23435	193 aa		16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RND3	P61587	244 aa		16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CTDSP2	O14595	271 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CD74	P04233	296 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR183	P32249	361 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TSC22D3	Q99576	134 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	HINT2	Q9BX68	163 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		16.42	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA6	P05013	189 aa		16.41	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		16.41	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMAT4	Q9H898	229 aa		16.41	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF320	A2RRD8	509 aa		16.4	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5B	O43169	146 aa		16.4	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PI3	P19957	117 aa		16.4	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		16.4	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	16.4	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		16.4	■□□□□ 0.22
PPP4C-205	ENST00000563200		F8W735	103 aa	Predicted RBP	16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	GABARAP	H6UMI1	98 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TGOLN2	O43493	480 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf88	P0DMB2	117 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TM4SF20	Q53R12	229 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM56	Q96MV1	263 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V0B	Q99437	205 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MLX	Q9UH92	298 aa		16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	16.39	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EIM0	57 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CD7	P09564	240 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TMBIM6	P55061	237 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGP	P57054	158 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CD81	P60033	236 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	HAGH	Q16775	308 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PLET1	Q6UQ28	207 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TERB2	Q8NHR7	220 aa		16.38	■□□□□ 0.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		16.38	■□□□□ 0.21

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