RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	8e-8	■□□□□ 8.5
RABGGTB-212	ENST00000491266	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	F8	P00451	2351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PPE2	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PR64	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PRV1	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNAB3	O43448	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHST1	O43916	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRAS	P01116	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGF2	P09038	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD1B	P29016	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAX9	P55771	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDP	Q00604	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HNF4G	Q14541	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSG5	Q15238	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGI3	Q8N145	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPE	Q96AT9	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	S1PR3	Q99500	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MED28	Q9H204	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A6NDX4	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPK2	O00526	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPAN4	O14817	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSNA1	O43805	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA3	O95167	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HPRT1	P00492	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERPINE2	P07093	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N9W7	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPB	Q8NG41	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHB2	Q99623	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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