RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	SERPINE2	P07093	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21	1e-32	■□□□□ 10
SNHG12-208	ENST00000481220	ARL3	P36405	182 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CTDSP2	O14595	271 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CD3D	P04234	171 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CLEC3B	P05452	202 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	FOLR2	P14207	255 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	MFAP2	P55001	183 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220		A8MWP6	167 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CD74	P04233	296 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	PRND	Q9UKY0	176 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TBP	P20226	339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CBLN1	P23435	193 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	RND3	P61587	244 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	THYN1	Q9P016	225 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	SNAPC5	O75971	98 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	S100G	P29377	79 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	IFNA6	P05013	189 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	PI3	P19957	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	GPR183	P32249	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TMBIM6	P55061	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220		K7EIM0	57 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	RGS5	O15539	181 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220		P0C879	139 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TERB2	Q8NHR7	220 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	MLX	Q9UH92	298 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	PIGP	P57054	158 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	TAS2R19	P59542	299 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	CYB5B	O43169	146 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	TGOLN2	O43493	480 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG12-208	ENST00000481220	RAB3D	O95716	219 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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