RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	CXorf58	Q96LI9	332 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	TUBA4B	Q9H853	241 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	TENM2	Q9NT68	2774 aa		8.98	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	TPPP	O94811	219 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	CLEC3B	P05452	202 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	SERPINE2	P07093	398 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFA4	P12838	97 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR183	P32249	361 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	LPAR6	P43657	344 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	VBP1	P61758	197 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	TM4SF20	Q53R12	229 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	BORCS5	Q969J3	196 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	ISOC1	Q96CN7	298 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	NSG2	Q9Y328	171 aa		8.97	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	8.96	□□□□□ -0.97
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	OR11H12	B2RN74	326 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR31	O00270	319 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	TGOLN2	O43493	480 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1-39	P01597	117 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	APOA1	P02647	267 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1D-39	P04432	117 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SMIM18	P0DKX4	95 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	HLA-DMA	P28067	261 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	G6PC	P35575	357 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	GUCA2B	Q16661	112 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	BTNL8	Q6UX41	500 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	CMTM3	Q96MX0	182 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	8.96	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	LCE6A	A0A183	80 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF320	A2RRD8	509 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464		K7EIM0	57 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	HPGDS	O60760	199 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	KRAS	P01116	189 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	OR13C7	P0DN81	318 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	ELK1	P19419	428 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	ADM	P35318	185 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	ERVK-16	P61578	105 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	CTF1	Q16619	201 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SEC22A	Q96IW7	307 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2T8	A6NH00	312 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	C15orf61	A6NNL5	157 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	GABARAP	O95166	117 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	RCVRN	P35243	200 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	UCP3	P55916	312 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	MARC2	Q969Z3	335 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V0B	Q99437	205 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464		M0QYG6	137 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNA6	P05013	189 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	PLET1	Q6UQ28	207 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5B3	Q8NH48	314 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	8.93	□□□□□ -0.98
PTPRF-211	ENST00000467464	PALMD	Q9NP74	551 aa		8.93	□□□□□ -0.98

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