RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMED6Q8WW62 240 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARPC1AQ92747 370 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF382Q96SR6 550 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC4Q99102 2169 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACER3Q9NUN7 267 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CALML5Q9NZT1 146 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCTPQ9UKL6 214 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB22AQ9UL26 194 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf98E9PRG8 122 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEGS1O15121 323 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ITM2AO43736 263 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OPN1SWP03999 348 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAP1AP62834 184 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC35A1P78382 337 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK5Q00535 292 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM187Q14656 261 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM57BQ71RH2 274 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDZD9Q8IXQ8 264 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8N1X5 172 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF485Q8NCK3 441 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BORCS7Q96B45 105 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALMQ96C23 342 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2M2Q96R28 347 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF167Q9H6Y7 350 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRL4Q9HBW9 690 aa4.4□□□□□ -1.7
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR5G3P0C626 314 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR8U8P0C7N1 319 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PATE4P0C8F1 98 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSG1P11464 419 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNB3P16520 340 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CA6P23280 308 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 S100A11P31949 105 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 REG1BP48304 166 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SELENOTP62341 195 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAXQ07812 192 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR7A5Q15622 319 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GSG1Q2KHT4 349 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGN2P46Q86SG4 172 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OAFQ86UD1 273 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC35F6Q8N357 371 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BEST4Q8NFU0 473 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYGBQ8WWM9 190 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf50Q9BV19 199 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00470Q9BZP3 86 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM126AQ9H061 195 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VCXQ9H320 206 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EHFQ9NZC4 300 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THYN1Q9P016 225 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HERC1Q15751 4861 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A087WX48 190 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A096LPI6 279 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 hDV102S1A0JD36 115 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PROP1O75360 226 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK2AP2O75956 126 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTRP02766 147 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFI6P09912 130 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GKN3PP0CG01 181 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCL3P20749 454 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMO1P25800 156 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPOP30536 169 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FMO3P31513 532 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPV17P39210 176 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MDH2P40926 338 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGA2P52926 109 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF626Q68DY1 528 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FA2HQ7L5A8 372 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOGA1Q86XE5 327 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OSR2Q8N2R0 312 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHST4Q8NCG5 386 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.4 ms