RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 DFFBO76075 338 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 HLA-DQB1P01920 261 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDK1P06493 297 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 UCHL1P09936 223 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF688P0C7X2 276 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYL12AP19105 171 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAS1LP35410 378 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERPINB10P48595 397 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 WNT4P56705 351 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR4S2Q8NH73 311 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM203Q969S6 136 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 CXorf58Q96LI9 332 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 GINS4Q9BRT9 223 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 NSG2Q9Y328 171 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1B0GU03 582 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMIM30A4D0T7 59 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 C15orf62A8K5M9 175 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7EMT4 169 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 SULT1C2O00338 296 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 UPK2O00526 184 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 SSX5O60225 188 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFNA10P01566 189 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRM2P04554 102 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 FCER2P06734 321 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERPINE2P07093 398 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR13C7P0DN81 318 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MIFP14174 115 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 HTN3P15516 51 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 XGP55808 180 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 HAMPP81172 84 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPBGQ13641 420 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB11BQ15907 218 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFSD4AQ8N468 514 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHYHIPQ92561 330 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR10C1Q96KK4 312 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM140Q9NV12 185 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 BET1LQ9NYM9 111 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 I3L2K1 104 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7EQG2 157 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYL12BO14950 172 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD1AP06126 327 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP2K4P45985 399 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP5CP53041 499 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 EMP1P54849 157 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 FXYD7P58549 80 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAS2R43P59537 309 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q56UQ5 140 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q5VSD8 79 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 STHQ8IWL8 128 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYGBQ8WWM9 190 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB3CQ96E17 227 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 VSIRQ9H7M9 311 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms