RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359947.8

PTPRF-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 7,727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-201ENST00000359947 CACNG7P62955 275 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 GTSCR1Q86UQ5 136 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 C21orf62Q9NYP8 219 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 PINLYPA6NC86 204 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 FOXF2Q12947 444 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 NRIP2Q9BQI9 281 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 35.5
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PTPRF-201ENST00000359947 EGR1P18146 543 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 CFHR1Q03591 330 aa13.14□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 ABCA4P78363 2273 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.14□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 HIST1H4GQ99525 98 aa13.13□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 TM4SF5O14894 197 aa13.13□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.13□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 SEMA5BQ9P283 1151 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 C17orf98A8MV24 154 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 CXCL2P19875 107 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 TMEM219Q86XT9 240 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 PET117Q6UWS5 81 aa13.12□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 E9PLN8 166 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 KIF26BQ2KJY2 2108 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.12□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 M0QZK8 103 aa13.11□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.11□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa13.11□□□□□ -0.31
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PTPRF-201ENST00000359947 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 19.2
PTPRF-201ENST00000359947 TMEM160Q9NX00 188 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 FAM90A26D6RGX4 464 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 NBR2O15453 112 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 FHITP49789 147 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRF-201ENST00000359947 ZNF585BQ52M93 769 aa13.09□□□□□ -0.31
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